תוכניות ייחודיות
פרוייקט נעל"ה

חניכי נעל"ה שהתקבלו לפנימייה ולביה"ס הם בני נוער בני 16-18 שהגיעו ממדינות חבר העמים. פרוייקט נעל"ה הינו מיזם משותף של הסוכנות היהודית בשיתוף עם "האגודה לקידום החינוך". מטרת העל – קליטת התלמידים בארץ בסביבה חינוכית מיטבית ועידוד הוריהם "לעשות עלייה " אחריהם. הפרוייקט פועל זו השנה ה- 15.
קבוצת התיאטרון
הקבוצה עובדת כבר שבע שנים בהנחייתו של המחזאי-מוסיקאי-במאי עידן זילברשטיין. חניכי הקבוצה לומדים להכיר את שפת התיאטרון מתוך קריאת מחזות, ניתוח דמויות, כתיבת טקסטים, צפייה בהצגות ורכישת כלים בעבודת השחקן. למידה זו מלווה בתהליכים חברתיים. מטרת הפעילות הינה להביא דרך תיאטרון מגיב, מעורה ורגיש לשילוב בין הכלים התיאטרליים להקניית ערכים חברתיים. חברי הקבוצה הפיקו את: "צבוע" (הצגה שעוסקת בקליטת יהודי אתיופיה בישראל), "רגעים יפים" (על התמודדות בני נוער עם פעולות הטרור),"זיכרונות מימים מאושרים"( על קשרי הורים וילדיהם המתבגרים), "טעונים" (סיפורם של בני נוער בתקופת השואה) ו"ילד חי או מת" ( התמודדות נוקבת בבעיית האלימות בקרב בני נוער) שני המחזות האחרונים זכו להצלחה רבה והועלו במקומות רבים ברחבי הארץ וכן בבריסל ופריז. בנוב' 2006 טסה קבוצת התיאטרון לבלגיה עפ"י הזמנת הקהילה היהודית בבריסל שאימצה אותנו, והציגה את המחזה בפני ראשי הקהילה, בתי ספר יהודיים ולא יהודיים.
"חממה" לספורטאים מצטיינים

בני נוער לכיתות ז' עד י"ב המצטיינים בכדורגל. המטרה: לחנך! להביא להישגים לימודיים גבוהים חניכים מוכשרים בכדורגל! חניכי הפנימייה מתאמנים בקבוצת בית"ר טוברוק נתניה, בהנהלתו המקצועית של שלמה שרף ובמכבי נתניה. ישנה הקפדה יתרה בבחירת המועמדים , כך שרק תלמידים מוכשרים ובעלי אחריות יצטרפו למסגרת. פרוייקט הכדורגל משתלב בתוכניות הספורטיביות של הפנימייה ובית הספר.
פנימיית יום
תכנית חינוכית של יום-לימודים- ארוך הפועל זו כבר השנה התשיעית בהצלחה רבה. בפרוייקט משתתפים 20 מתלמידי חטיבת הביניים (ז' - ט') של ביה"ס. התלמידים מקבלים ארוחת צהריים חמה, עזרה בשיעורי בית ממורים מקצועיים וכן העשרה ופעילות חברתית.